55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0986 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0986  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 102 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1164  iron-sulfur cluster-binding protein  79.8 
 
 		 102 aa  167  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.624283  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_965  iron-sulfur cluster-binding protein  81.72 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0363089  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4337  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.18 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322839 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6638  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  39.39 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108852  normal  0.0651062 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1769  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.38 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2381  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2386  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.479813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3785  putative 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.18 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1530  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.67 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  33.33 
 
 		 319 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1469  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1565  iron-sulfur cluster-binding protein  37.18 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000782639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2754  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.5 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.72 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3046  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  36.36 
 
 		 1190 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17770  polyferredoxin, heterodixulfide reductase subunit A  33.33 
 
 		 660 aa  44.7  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0113  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.49 
 
 		 62 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4052  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 1192 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0539236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.04 
 
 		 431 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.72 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  33.75 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2120  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.71 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 		 432 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0879  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.638489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1200  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.5 
 
 		 656 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.708049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 		 432 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0490  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  29.11 
 
 		 1170 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.836719  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0264  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2243  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.65 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000430291  normal  0.0350481 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0475  pyruvate:ferredoxin oxidoreductase, fusion of alpha, beta and gamma subunit  33.75 
 
 		 1223 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1260  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 		 656 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1328  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  32.93 
 
 		 1184 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000692132 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3120  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase-like protein  31.46 
 
 		 1178 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  35.8 
 
 		 331 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1096  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  32.14 
 
 		 266 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0514529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1034  NifJ-like oxidoreductase, Fe-S subunit  33.78 
 
 		 1180 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.57 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3775  ferredoxin I  29.63 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0541  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  32.5 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1213  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  35.9 
 
 		 1192 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2840  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  32 
 
 		 1212 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1080  ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  33.77 
 
 		 1190 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4954  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  32.53 
 
 		 1191 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4865  pyruvate:ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  32.53 
 
 		 1191 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0730  pyruvate--ferredoxin (flavodoxin) oxidoreductase  30.77 
 
 		 1208 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0463  pyruvate-flavoredoxin oxidoreductase  30.34 
 
 		 1079 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0388301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0627  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.132482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0088  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1207 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1261  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 1222 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0237  hypothetical protein  29.11 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.903912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0054  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 		 1176 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00219154  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1306  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 		 656 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>