18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3472 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3472  Arc domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  318  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4270  Arc-like DNA binding  37.96 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000419357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4470  Arc domain protein DNA binding domain protein  39.81 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3759  Arc domain-containing protein  39.81 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00438453  normal  0.429841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3975  Arc domain-containing protein  40.21 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1847  transcriptional repressor, putative  35.85 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0272963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3551  Arc-like DNA binding  35.85 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000403187  normal  0.301278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2891  Arc domain-containing protein  52.94 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00172735  normal  0.758629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1445  Arc domain-containing protein  38.68 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20290  DNA binding-protein  38.38 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0669887  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4453  putative DNA binding protein  48.84 
 
 		 89 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59060  hypothetical protein  48.89 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026406  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1528  Arc-like DNA binding  58.82 
 
 		 87 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2213  putative transcriptional regulator  55.56 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.561441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2124  Arc domain-containing protein  39.34 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1744  hypothetical protein  47.92 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.972631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0670  Arc domain-containing protein  55.88 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.17642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3252  Arc domain-containing protein  37.84 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000479453  hitchhiker  0.0000000000000551778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>