17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1528 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1528  Arc-like DNA binding  100 
 
 		 87 aa  176  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1847  transcriptional repressor, putative  65.79 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0272963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3551  Arc-like DNA binding  65.79 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000403187  normal  0.301278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4453  putative DNA binding protein  37.66 
 
 		 89 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59060  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026406  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3759  Arc domain-containing protein  60.53 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00438453  normal  0.429841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4470  Arc domain protein DNA binding domain protein  60.53 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3975  Arc domain-containing protein  60.53 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1445  Arc domain-containing protein  60.53 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2891  Arc domain-containing protein  56.1 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00172735  normal  0.758629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20290  DNA binding-protein  56.1 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0669887  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4270  Arc-like DNA binding  60.53 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000419357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3472  Arc domain-containing protein  58.82 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0670  Arc domain-containing protein  48.84 
 
 		 172 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.17642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2213  putative transcriptional regulator  40.38 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.561441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2124  Arc domain-containing protein  34.92 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3774  Arc domain-containing protein  40.54 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331674  unclonable  0.0000139531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>