20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_20290  DNA binding-protein  100 
 
 		 108 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0669887  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4470  Arc domain protein DNA binding domain protein  85.85 
 
 		 108 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3759  Arc domain-containing protein  85.85 
 
 		 108 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00438453  normal  0.429841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3975  Arc domain-containing protein  85.85 
 
 		 108 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4270  Arc-like DNA binding  85.85 
 
 		 108 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000419357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1445  Arc domain-containing protein  85.44 
 
 		 105 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1847  transcriptional repressor, putative  81.13 
 
 		 108 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0272963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3551  Arc-like DNA binding  81.13 
 
 		 108 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000403187  normal  0.301278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2891  Arc domain-containing protein  84.91 
 
 		 108 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00172735  normal  0.758629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1744  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.972631  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34410  AlgZ-like DNA binding protein  87.69 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.40686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3472  Arc domain-containing protein  38.38 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2213  putative transcriptional regulator  41.25 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.561441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59060  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026406  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4453  putative DNA binding protein  48 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1528  Arc-like DNA binding  56.1 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0670  Arc domain-containing protein  37.33 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.17642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1717  Arc domain-containing protein  41.18 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000298141  unclonable  0.0000000100109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3402  Arc domain-containing protein  37.5 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000582417  unclonable  1.23131e-16 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7066  Arc domain protein DNA binding domain protein  33.33 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000570212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>