15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2124 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2124  Arc domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1717  Arc domain-containing protein  62.5 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000298141  unclonable  0.0000000100109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3402  Arc domain-containing protein  46.51 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000582417  unclonable  1.23131e-16 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1200  Arc domain-containing protein  46.67 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0652  Mnt  55.56 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.778428 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7066  Arc domain protein DNA binding domain protein  44.19 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000570212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3472  Arc domain-containing protein  39.34 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3774  Arc domain-containing protein  41.51 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331674  unclonable  0.0000139531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1528  Arc-like DNA binding  34.92 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1027  hypothetical protein  45.95 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3252  Arc domain-containing protein  57.58 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000479453  hitchhiker  0.0000000000000551778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3401  Arc domain-containing protein  52.78 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000104471  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51750  hypothetical protein  46.51 
 
 		 107 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1847  transcriptional repressor, putative  32.35 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0272963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3551  Arc-like DNA binding  32.35 
 
 		 108 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000403187  normal  0.301278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>