16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2213 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2213  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.561441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4470  Arc domain protein DNA binding domain protein  43.75 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.197057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1445  Arc domain-containing protein  43.75 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3975  Arc domain-containing protein  43.75 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.479627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3759  Arc domain-containing protein  43.75 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00438453  normal  0.429841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4270  Arc-like DNA binding  37.08 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000419357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20290  DNA binding-protein  41.25 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0669887  normal  0.454428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1847  transcriptional repressor, putative  42.5 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0272963  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3551  Arc-like DNA binding  42.5 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000403187  normal  0.301278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2891  Arc domain-containing protein  42.5 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00172735  normal  0.758629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0652  Mnt  38.75 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.778428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0670  Arc domain-containing protein  48.98 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.17642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3472  Arc domain-containing protein  55.56 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4453  putative DNA binding protein  35.71 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1528  Arc-like DNA binding  40.38 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2879  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>