More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1301 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1301  ISDet4, transposase  100 
 
 
413 aa  857    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0888  transposase mutator type  56.51 
 
 
401 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010764  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1079  transposase mutator type  56.51 
 
 
401 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120456  normal  0.0282753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1550  transposase mutator type  54.26 
 
 
407 aa  467  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2013  transposase mutator type  51.92 
 
 
407 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2671  transposase, mutator type  52.42 
 
 
407 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0371  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0356  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0148  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1193  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1874  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3051  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1901  transposase, mutator type  51.91 
 
 
407 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1533  transposase, mutator type  52.16 
 
 
407 aa  458  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0970  transposase, mutator type  51.91 
 
 
407 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3207  transposase, mutator type  51.91 
 
 
407 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3216  transposase, mutator type  51.91 
 
 
407 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1998  transposase mutator type  50.9 
 
 
407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0801  transposase, mutator type  51.65 
 
 
407 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0508  transposase mutator type  55.19 
 
 
369 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2858  transposase, mutator type  52.91 
 
 
378 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0176632  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  50.26 
 
 
408 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1824  transposase, mutator type  48.34 
 
 
403 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1991  transposase, mutator type  53.05 
 
 
328 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  46.27 
 
 
403 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0630  ISCpe3, transposase  45.32 
 
 
407 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  46.25 
 
 
402 aa  379  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  45.75 
 
 
408 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  45.75 
 
 
408 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  45.75 
 
 
408 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  45.75 
 
 
408 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  45.75 
 
 
408 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  45.48 
 
 
404 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  45.48 
 
 
404 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  44.39 
 
 
425 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  45.5 
 
 
408 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  45.75 
 
 
408 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  45.89 
 
 
404 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  45.89 
 
 
404 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  44.39 
 
 
425 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  44.39 
 
 
425 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  45.89 
 
 
404 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  44.44 
 
 
402 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  44.44 
 
 
402 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  44.44 
 
 
402 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  44.44 
 
 
402 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  44.14 
 
 
425 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  43.89 
 
 
425 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  45.62 
 
 
404 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  44.96 
 
 
402 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  45.55 
 
 
426 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  45.55 
 
 
426 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  45.55 
 
 
426 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  44.96 
 
 
402 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  45.22 
 
 
402 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  44.96 
 
 
402 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  44.7 
 
 
402 aa  363  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>