More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2858 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1533  transposase, mutator type  99.21 
 
 
407 aa  770    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0356  transposase, mutator type  99.47 
 
 
407 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1901  transposase, mutator type  99.21 
 
 
407 aa  771    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2671  transposase, mutator type  99.21 
 
 
407 aa  770    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1991  transposase, mutator type  98.78 
 
 
328 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0148  transposase, mutator type  99.47 
 
 
407 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1874  transposase, mutator type  99.47 
 
 
407 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2858  transposase, mutator type  100 
 
 
378 aa  776    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0176632  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0371  transposase, mutator type  99.47 
 
 
407 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3207  transposase, mutator type  99.21 
 
 
407 aa  771    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0801  transposase, mutator type  98.15 
 
 
407 aa  763    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3051  transposase, mutator type  99.47 
 
 
407 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0970  transposase, mutator type  99.21 
 
 
407 aa  771    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3216  transposase, mutator type  99.21 
 
 
407 aa  769    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1193  transposase, mutator type  99.47 
 
 
407 aa  772    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2013  transposase mutator type  57.71 
 
 
407 aa  491  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1998  transposase mutator type  57.71 
 
 
407 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2832  transposase, mutator type  97.85 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.908202  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1301  ISDet4, transposase  52.91 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03799  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0888  transposase mutator type  52.12 
 
 
401 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010764  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1079  transposase mutator type  52.12 
 
 
401 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120456  normal  0.0282753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1550  transposase mutator type  51.19 
 
 
407 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1824  transposase, mutator type  50.26 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0630  ISCpe3, transposase  52.8 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0508  transposase mutator type  51.1 
 
 
369 aa  411  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  49.6 
 
 
408 aa  412  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  45.19 
 
 
404 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  45.19 
 
 
404 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  45.19 
 
 
404 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  44.65 
 
 
404 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2292  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0130  ISSod4, transposase  43.8 
 
 
400 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0364  transposase, mutator type  43.04 
 
 
400 aa  371  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2058  transposase, mutator type  43.22 
 
 
400 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2176  transposase, mutator type  43.04 
 
 
400 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0356  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0378  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0596  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  43.24 
 
 
403 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1026  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1269  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1438  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1616  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1767  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1875  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2078  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2272  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2321  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2344  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2392  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2050  transposase, mutator type  43.73 
 
 
399 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2811  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2817  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3044  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3399  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3443  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3451  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3518  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3522  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3604  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3712  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3752  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3824  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3858  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3876  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3882  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3944  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4024  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4165  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4259  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4386  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4545  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4582  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4707  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0035  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0083  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.21164  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0144  ISSod4, transposase  43.54 
 
 
400 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.713152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3720  transposase, mutator type  42.53 
 
 
400 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  45.63 
 
 
411 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  44.65 
 
 
408 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  44.39 
 
 
408 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  44.65 
 
 
408 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  44.65 
 
 
408 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  44.39 
 
 
408 aa  365  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  44.39 
 
 
408 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  44.39 
 
 
408 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3078  transposase mutator type  44.8 
 
 
400 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  45.5 
 
 
402 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  45.31 
 
 
402 aa  362  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  45.78 
 
 
402 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  45.78 
 
 
402 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  45.78 
 
 
402 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  45.78 
 
 
402 aa  362  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>