50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1217 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1217  acetyltransferase  100 
 
 		 163 aa  326  6e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1000  acetyltransferase, GNAT family  96.32 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  88.96 
 
 		 163 aa  290  6e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2746  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002917 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  27.83 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 331 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 314 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  24.78 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5849  putative acetyltransferase  23.64 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0044  acetyltransferase  26.55 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000637954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  27.92 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1629  GCN5-related N-acetyltransferase  25.78 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0069125  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  32 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0139  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 		 173 aa  43.9  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  26.04 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  31.2 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 294 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0146577  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 269 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0511  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0498  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.354462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  22.52 
 
 		 196 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  26.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  27.2 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  24.24 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  31.2 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03050  predicted acetyltransferase  28.75 
 
 		 211 aa  41.2  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4543  GCN5-related N-acetyltransferase  22.09 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6099  putative acetyltransferase family protein  30.58 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  24.77 
 
 		 211 aa  40.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00772  acetyltransferase  29.79 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>