83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1000 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1000  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 		 163 aa  328  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1217  acetyltransferase  96.32 
 
 		 163 aa  315  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  89.57 
 
 		 163 aa  295  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3352  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1158  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 		 214 aa  70.5  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1804  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2354  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2528  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0482424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3726  acetyltransferase  25.88 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.232857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2746  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000002917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  25.95 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1503  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1226  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 314 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000639538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 331 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1629  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2771  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 		 196 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0261  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 		 202 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.251276  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0139  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2979  GCN5-related N-acetyltransferase  23.95 
 
 		 173 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.146228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2520  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.178177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0873  acetyltransferase  28.4 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00821598  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0069125  normal  0.108767 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0044  acetyltransferase  27.43 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000637954  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4244  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3389  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3514  acetyltransferase, GNAT family  31.54 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0608  putative acetyltransferase  24.36 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3195  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5849  putative acetyltransferase  23.64 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002621  acetyltransferase  25.32 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  25.76 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0858  acetyltransferase  27.78 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000408067  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2795  acetyltransferase  27.08 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00772  acetyltransferase  31.91 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00945264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3498  acetyltransferase  31.2 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0380863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3688  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106942  normal  0.465319 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03385  hypothetical protein  25.95 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1780  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 294 aa  43.9  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0146577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2432  GCN5-related N-acetyltransferase  26.56 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.651121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3485  acetyltransferase, GNAT family  31.2 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.214419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2223  GCN5-related N-acetyltransferase  22.52 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2218  GCN5-related N-acetyltransferase  24.77 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  26.32 
 
 		 464 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4047  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3579  acetyltransferase  29.69 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3713  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2461  acetyltransferase  31.96 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2775  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3335  GCN5-related N-acetyltransferase  30.4 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2341  acetyltransferase  31.96 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3804  acetyltransferase  27.66 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04173  predicted acetyltransferase  25.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3692  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1445  acetyltransferase  34.88 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04135  hypothetical protein  25.64 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2458  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000358047  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1936  acetyltransferase  34.88 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3369  acetyltransferase  34.88 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.435865  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1209  acetyltransferase  34.88 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4800  acetyltransferase  25 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4543  GCN5-related N-acetyltransferase  23.91 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.56586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5053  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 		 186 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0147908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0152  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 184 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.778253  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03050  predicted acetyltransferase  27.85 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 170 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.458197  normal  0.582015 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7266  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3258  acetyltransferase  30 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3204  acetyltransferase  30 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1846  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1764  acetyltransferase, GNAT family  29.6 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0566634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0635  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000069147  unclonable  0.000000000111993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4193  GCN5-related N-acetyltransferase  22.36 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0186  putative acetyltransferase  29.37 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1598  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000922964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.611094  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1820  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.209618  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 269 aa  40.8  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1361  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 		 185 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3315  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 174 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718101  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>