11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2596 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2596  tocopherol cyclase  100 
 
 
358 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0507139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2735  tocopherol cyclase  66.2 
 
 
358 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3505  hypothetical protein  64.25 
 
 
365 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1802  tocopherol cyclase  65.08 
 
 
358 aa  476  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.168852  hitchhiker  0.0029658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0003  hypothetical protein  60.61 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1107  hypothetical protein  53.95 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1078  tocopherol cyclase  53.67 
 
 
363 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39591  predicted protein  40.76 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.690672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1994  hypothetical protein  21.11 
 
 
325 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4428  hypothetical protein  25.39 
 
 
329 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9076  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16430  hypothetical protein  29.06 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.519387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>