11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1802 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1802  tocopherol cyclase  100 
 
 
358 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.168852  hitchhiker  0.0029658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2735  tocopherol cyclase  72.65 
 
 
358 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3505  hypothetical protein  72.08 
 
 
365 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0003  hypothetical protein  66.76 
 
 
368 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2596  tocopherol cyclase  65.08 
 
 
358 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0507139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1107  hypothetical protein  55.43 
 
 
363 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1078  tocopherol cyclase  55.43 
 
 
363 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39591  predicted protein  42.74 
 
 
296 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.690672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4428  hypothetical protein  23.96 
 
 
329 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9076  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1994  hypothetical protein  23.2 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1028  hypothetical protein  30.83 
 
 
493 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>