13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1994 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1994  hypothetical protein  100 
 
 
325 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1141  hypothetical protein  30.41 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000454744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3007  hypothetical protein  30.1 
 
 
280 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1107  hypothetical protein  23.56 
 
 
363 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0003  hypothetical protein  21.99 
 
 
368 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1078  tocopherol cyclase  23.04 
 
 
363 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4428  hypothetical protein  21.04 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3505  hypothetical protein  23.08 
 
 
365 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2596  tocopherol cyclase  21.11 
 
 
358 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0507139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2735  tocopherol cyclase  23.08 
 
 
358 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1802  tocopherol cyclase  23.2 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.168852  hitchhiker  0.0029658 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39591  predicted protein  22.12 
 
 
296 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.690672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3278  hypothetical protein  41.82 
 
 
121 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>