11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0003 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0003  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  766    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2735  tocopherol cyclase  67.52 
 
 
358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3505  hypothetical protein  68.56 
 
 
365 aa  515  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1802  tocopherol cyclase  66.76 
 
 
358 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.168852  hitchhiker  0.0029658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2596  tocopherol cyclase  60.61 
 
 
358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0507139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1107  hypothetical protein  58.21 
 
 
363 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1078  tocopherol cyclase  58.21 
 
 
363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39591  predicted protein  44.77 
 
 
296 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.690672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1994  hypothetical protein  21.99 
 
 
325 aa  67  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4428  hypothetical protein  25.39 
 
 
329 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9076  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1141  hypothetical protein  24.64 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000454744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>