17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1983 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1983  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  938    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.523491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4968  hypothetical protein  67.74 
 
 
455 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4567  hypothetical protein  62.82 
 
 
448 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1964  hypothetical protein  59.2 
 
 
444 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1991  hypothetical protein  59.42 
 
 
444 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  0.0451429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4059  hypothetical protein  49.67 
 
 
464 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7862  hypothetical protein  47.97 
 
 
442 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6646  Protein of unknown function DUF2330  42.46 
 
 
549 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0856  hypothetical protein  25.94 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4008  hypothetical protein  22.9 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13764  hypothetical protein  25.1 
 
 
352 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.815237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3357  hypothetical protein  24.24 
 
 
585 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.205897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3358  hypothetical protein  26.05 
 
 
598 aa  59.7  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0055195  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3359  hypothetical protein  24.54 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0360212  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3356  hypothetical protein  26.05 
 
 
603 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1584  hypothetical protein  22.65 
 
 
363 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0816  hypothetical protein  22.46 
 
 
354 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844622  normal  0.890446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>