17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4008 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4008  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  720    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13764  hypothetical protein  37.8 
 
 
352 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.815237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0816  hypothetical protein  36.41 
 
 
354 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.844622  normal  0.890446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1584  hypothetical protein  34.31 
 
 
363 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0856  hypothetical protein  27.33 
 
 
404 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4968  hypothetical protein  27.23 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1964  hypothetical protein  24.83 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1983  hypothetical protein  23.57 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.523491 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1991  hypothetical protein  24.49 
 
 
444 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.340424  normal  0.0451429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7862  hypothetical protein  27.78 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3357  hypothetical protein  28.86 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.205897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4059  hypothetical protein  26.64 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3356  hypothetical protein  30.28 
 
 
603 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4567  hypothetical protein  23.79 
 
 
448 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3359  hypothetical protein  34.95 
 
 
585 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0360212  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3358  hypothetical protein  27.65 
 
 
598 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0055195  normal  0.200349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6646  Protein of unknown function DUF2330  25.21 
 
 
549 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>