26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5716 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5716  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1791  GCN5-related N-acetyltransferase  59.42 
 
 		 192 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0524731  hitchhiker  0.000628813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1182  acetyltransferase  52.05 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000296086  decreased coverage  0.00782832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2348  acetyltransferase  31.15 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1262  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00212667  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3906  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.243452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2671  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.741508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4881  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 197 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1149  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5244  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109908  normal  0.421664 
 
 
-
 
NC_002936  DET0975  acetyltransferase  32.79 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.271332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.88 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  decreased coverage  0.00000264624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10134  acetyltransferase  32.76 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0866  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 		 209 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.965462  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_848  acetyltransferase  30.65 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000296712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2298  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019963  hitchhiker  0.00182548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3560  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3497  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3510  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.581101 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 198 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.608599  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2400  hypothetical protein  35.09 
 
 		 215 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.915139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2850  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5274  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 		 137 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0801  acetyltransferase  33.9 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.587739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4097  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 200 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>