11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0101 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0101  hypothetical protein  100 
 
 		 1526 aa  3127    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5217  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1525 aa  187  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1263  ATPas  24.49 
 
 		 1564 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1996  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1482 aa  125  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.141333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2009  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1526 aa  124  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1656  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1716 aa  118  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3574  hypothetical protein  28.63 
 
 		 468 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3713  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1524 aa  80.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0763759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2965  hypothetical protein  35.45 
 
 		 755 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4795  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1809 aa  48.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0639  hypothetical protein  20.23 
 
 		 1622 aa  46.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>