34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_R0041 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_R0041  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458383  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0033  tRNA-His  95.92 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0006  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0049  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000343908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0017  tRNA-His  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000374304  hitchhiker  0.000000156779 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0034  tRNA-His  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0016  tRNA-His  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0319079  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t38  tRNA-His  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0045  tRNA-His  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000161818  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0031  tRNA-His  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000176121  normal  0.0395456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0024  tRNA-His  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.62576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0028  tRNA-His  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.252923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0041  tRNA-His  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0113138  normal  0.890079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0044  tRNA-His  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000342103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0021  tRNA-His  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0011  tRNA-His  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0052  tRNA-His  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0296253  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06590  tRNA-His  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.435394 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0016  tRNA-Ala  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  unclonable  0.0000000248752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0049  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.85452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.488944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34020  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.73239  normal  0.53918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0037  tRNA-His  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000665099  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0074  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0073  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.524429 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13120  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.100259  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01860  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.521016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0006  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0055  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509832  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0055  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0007  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>