19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2944 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2944  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000251122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0799  hypothetical protein  36.27 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3272  hypothetical protein  32.08 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000705988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1506  hypothetical protein  30.57 
 
 
393 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1050  NLP/P60 protein  30.69 
 
 
180 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.816748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1353  NLP/P60 family protein, enterotoxin  30.56 
 
 
549 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.185421  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.94 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1562  NlpC/P60 family protein  28.57 
 
 
553 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000246871  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  26.26 
 
 
319 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  25.77 
 
 
256 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  26.83 
 
 
271 aa  41.6  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  26.83 
 
 
275 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.179042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>