87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1507 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1507  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0819  hypothetical protein  35.78 
 
 
112 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.186166  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5583  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1899  protein of unknown function DUF74  29.36 
 
 
107 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0788  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1519  protein of unknown function DUF74  27.78 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14850  hypothetical protein  28.18 
 
 
108 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.271966  normal  0.284352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1891  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00410284  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1021  hypothetical protein  32.93 
 
 
120 aa  52.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0559796  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0912  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1095  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.172512  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0052  hypothetical protein  31.78 
 
 
103 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0904  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1168  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1001  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0936  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0039  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1042  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0921  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0288  hypothetical protein  33.94 
 
 
106 aa  52  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.118688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1077  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14878e-50 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5284  hypothetical protein  31.78 
 
 
103 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5297  hypothetical protein  31.78 
 
 
103 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1357  hypothetical protein  27.93 
 
 
110 aa  51.2  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0206753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3206  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3460  hypothetical protein  29.91 
 
 
103 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00419456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4973  hypothetical protein  31.78 
 
 
103 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4261  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000396141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1016  hypothetical protein  28.97 
 
 
103 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000549943  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1243  hypothetical protein  28.3 
 
 
104 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5342  hypothetical protein  30.84 
 
 
103 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2275  protein of unknown function DUF74  31.78 
 
 
109 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0398  hypothetical protein  27.78 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000107451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3455  hypothetical protein  28.3 
 
 
103 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177402  hitchhiker  4.0879300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0253  hypothetical protein  31.4 
 
 
105 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1703  hypothetical protein  28.97 
 
 
107 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.073089  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0990  hypothetical protein  25.45 
 
 
114 aa  48.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.880339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1969  hypothetical protein  29.91 
 
 
107 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3098  protein of unknown function DUF74  27.27 
 
 
109 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4859  hypothetical protein  28.97 
 
 
103 aa  47.8  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0034  protein of unknown function DUF74  30.63 
 
 
107 aa  47.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.347076  normal  0.179218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5267  hypothetical protein  28.97 
 
 
103 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4874  hypothetical protein  28.97 
 
 
103 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1745  hypothetical protein  24.77 
 
 
106 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305232  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2464  hypothetical protein  27.36 
 
 
104 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1628  UPF0145 protein  28.04 
 
 
104 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.546028  hitchhiker  0.00080679 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0236  protein of unknown function DUF74  33.33 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0782023 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3855  protein of unknown function DUF74  28.7 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0452  protein of unknown function DUF74  29.82 
 
 
107 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0898419  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2426  protein of unknown function DUF74  29.57 
 
 
119 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0498449  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0709  protein of unknown function DUF74  30.43 
 
 
122 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3926  hypothetical protein  37.88 
 
 
103 aa  45.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0545  protein of unknown function DUF74  28.18 
 
 
106 aa  45.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1658  hypothetical protein  28.3 
 
 
107 aa  45.1  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.737691  normal  0.699985 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1129  hypothetical protein  23.58 
 
 
108 aa  45.1  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2180  hypothetical protein  27.84 
 
 
144 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.907346  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2142  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0255  hypothetical protein  29.07 
 
 
105 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1287  protein of unknown function DUF74  25 
 
 
104 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1853  hypothetical protein  28.87 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.954454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3023  hypothetical protein  29.25 
 
 
106 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.476002  normal  0.201979 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1368  protein of unknown function DUF74  30.84 
 
 
107 aa  44.3  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.629963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0734  protein of unknown function DUF74  27.52 
 
 
111 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.639133  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2231  protein of unknown function DUF74  28.57 
 
 
111 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.286972  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2109  hypothetical protein  29.46 
 
 
108 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184022 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0734  hypothetical protein  29.91 
 
 
106 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.827812  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0329  protein of unknown function DUF74  30 
 
 
106 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.905778 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0165  hypothetical protein  24.3 
 
 
106 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2155  hypothetical protein  27.1 
 
 
103 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0163  hypothetical protein  24.3 
 
 
106 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000405251  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3365  hypothetical protein  23.85 
 
 
107 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148823  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2361  hypothetical protein  28.3 
 
 
103 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1624  hypothetical protein  26.17 
 
 
105 aa  42.4  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000293634  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1099  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  41.6  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.261096  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0338  hypothetical protein  33.03 
 
 
105 aa  42  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0345405  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1285  hypothetical protein  24.77 
 
 
107 aa  41.6  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.424427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1382  hypothetical protein  27.88 
 
 
107 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35022  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1015  protein of unknown function DUF74  25 
 
 
104 aa  41.6  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.512702  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2093  hypothetical protein  27.36 
 
 
103 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297611  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2241  hypothetical protein  25.93 
 
 
105 aa  41.2  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0997  hypothetical protein  27.88 
 
 
107 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0439  hypothetical protein  27.36 
 
 
103 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.130742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2196  protein of unknown function DUF74  27.1 
 
 
105 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0930  hypothetical protein  27.88 
 
 
107 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1047  hypothetical protein  27.88 
 
 
107 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1028  hypothetical protein  27.88 
 
 
107 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0965  hypothetical protein  27.88 
 
 
107 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>