12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0004 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0004  tRNA-Pro  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.781596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt29  tRNA-Pro  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0108  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0033  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000189735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0013  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0055  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0012  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0011  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0006  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>