26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0964 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0964  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
350 aa  717    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01281  hypothetical protein  29.72 
 
 
347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0075  hypothetical protein  25.76 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0186  hypothetical protein  22.52 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0110  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.769196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2229  hypothetical protein  21.78 
 
 
372 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  43.14 
 
 
615 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4094  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
509 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108712  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1408  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2034  hypothetical protein  43.75 
 
 
331 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0197  hypothetical protein  23.84 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.759361  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0481  hypothetical protein  24.26 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0891  glycosyl transferase group 1  38.78 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0889  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
327 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1400  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 
571 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.79 
 
 
364 aa  44.3  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 
367 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
402 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  71.43 
 
 
369 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
352 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
378 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  42.55 
 
 
419 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>