15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01281 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01281  hypothetical protein  100 
 
 
347 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0964  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.303622  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2229  hypothetical protein  26.79 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0186  hypothetical protein  28.74 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0075  hypothetical protein  31.52 
 
 
343 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0110  hypothetical protein  25.41 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.769196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
615 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
352 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2676  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
372 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00158142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3183  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0351  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
325 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  27.07 
 
 
444 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1106  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>