30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0132 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0132  radical SAM domain protein  100 
 
 
285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.717218  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1605  hypothetical protein  57.8 
 
 
305 aa  325  6e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1692  radical SAM family protein  39.65 
 
 
290 aa  201  8e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1690  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 
297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
292 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.47 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 
292 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1747  radical SAM family protein  33.96 
 
 
264 aa  143  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0122  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
289 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  29.09 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 
296 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  20.54 
 
 
322 aa  48.9  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  20.33 
 
 
358 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  21.14 
 
 
339 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 
338 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 
332 aa  46.2  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  20.54 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  22.03 
 
 
342 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
345 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 
341 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>