13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4985 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  37.24 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  36.55 
 
 
209 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  40.82 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  34.21 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  38.83 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  32.09 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  34.74 
 
 
181 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5729  hypothetical protein  29.11 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.687337  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1790  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2402  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2406  hypothetical protein  31.21 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  0.0117496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>