8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3662 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3662  von Willebrand factor type D protein  100 
 
 		 2041 aa  4055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1004  von Willebrand factor type D protein  27.73 
 
 		 2998 aa  89.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.14 
 
 		 1372 aa  81.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  21.67 
 
 		 1156 aa  68.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03920  putative transmembrane protein  30.08 
 
 		 652 aa  60.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  20.18 
 
 		 1594 aa  59.3  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 		 1154 aa  51.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  27.11 
 
 		 1883 aa  49.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>