235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2674 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2997  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000491058  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2674  50S ribosomal protein L34  100 
 
 		 44 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000637872  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2414  50S ribosomal protein L34  84.09 
 
 		 44 aa  70.1  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000429596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2935  ribosomal protein L34  80.49 
 
 		 44 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000367166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0092  ribosomal protein L34  75.61 
 
 		 44 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1568  50S ribosomal protein L34  73.17 
 
 		 47 aa  60.8  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0660974  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4370  ribosomal protein L34  75.61 
 
 		 44 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.09492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4138  ribosomal protein L34  73.17 
 
 		 45 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00368218  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0001  50S ribosomal protein L34  73.17 
 
 		 45 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000166725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2793  50S ribosomal protein L34  73.17 
 
 		 45 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.202877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1944  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00370795  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28540  LSU ribosomal protein L34P  72.5 
 
 		 44 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000649644  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2238  ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  57  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.773424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3434  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3946  50S ribosomal protein L34  63.64 
 
 		 44 aa  56.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1898  ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000611674  hitchhiker  3.5180100000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2065  50S ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000217746  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0709  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 48 aa  56.6  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2119  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0204  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3562  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0220  50S ribosomal protein L34P  68.29 
 
 		 51 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1540  ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000041199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4361  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2950  ribosomal protein L34  70.73 
 
 		 44 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000318423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4517  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4498  50S ribosomal protein L34  68.18 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4028  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.105181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5639  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5598  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5341  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000589989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5185  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5615  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.106423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5675  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0134  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 52 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5738  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0731881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5281  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5320  50S ribosomal protein L34  68.29 
 
 		 44 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0521  ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.907647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2763  ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 52 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000022911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1864  50S ribosomal protein L34P  68.29 
 
 		 44 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.670126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52480  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2577  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6371  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4623  50S ribosomal protein L34P  63.41 
 
 		 44 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3089  ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2161  50S ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 45 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2038  ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3608  ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0009  50S ribosomal protein L34  62.5 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0031  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 46 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00441669  normal  0.196138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0002  50S ribosomal protein L34  62.5 
 
 		 44 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0279  ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5615  ribosomal protein L34  62.5 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5137  50S ribosomal protein L34  62.5 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4038  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 46 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.34188  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1787  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0214193  normal  0.25456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3921  ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250811  normal  0.369762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7100  ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 47 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2558  ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 45 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000028537  normal  0.271528 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf883  ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 48 aa  51.2  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2088  50S ribosomal protein L34  65.85 
 
 		 44 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0135a  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000390368  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4593  50S ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 45 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0000549229  decreased coverage  0.0000848449 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1437  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9056  ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 45 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00101546  normal  0.317071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4045  50S ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 46 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5111  50S ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 45 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480023  unclonable  0.0000000124693 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl682.1  50S ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 44 aa  50.8  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3117  50S ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 47 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0036  50S ribosomal protein L34  65 
 
 		 44 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.398714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38060  LSU ribosomal protein L34P  56.1 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0374  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136246  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0096  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 52 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3730  ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 49 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.458139 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0551  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  50.8  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31980  LSU ribosomal protein L34P  56.1 
 
 		 45 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7341  50S ribosomal protein L34  53.66 
 
 		 45 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0035  50S ribosomal protein L34  65 
 
 		 44 aa  50.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.766539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0046  ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 44 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2243  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.914999  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4868  ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 47 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000339328  hitchhiker  0.00961108 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1543  ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 52 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.185024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5415  50S ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 45 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0870  50S ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 44 aa  50.1  0.000009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0081  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6059  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0823674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2138  ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12828  hypothetical protein  58.54 
 
 		 52 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9389  50S ribosomal protein L34P  56.1 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0319883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1793  50S ribosomal protein L34  63.41 
 
 		 44 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000343039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4908  50S ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 44 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4315  ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 44 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000480274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5096  ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 45 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4225  ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3505  50S ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 44 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0561624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6078  50S ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 47 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0153372  normal  0.186265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1055  ribosomal protein L34  60.98 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4116  50S ribosomal protein L34  58.54 
 
 		 44 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0205607  normal  0.0561719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0828  50S ribosomal protein L34  56.1 
 
 		 47 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>