13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0488 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0488  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0500  hypothetical protein  92.91 
 
 
268 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00540555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1364  hypothetical protein  27.57 
 
 
392 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000024275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  28.05 
 
 
216 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  28.05 
 
 
185 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  28.05 
 
 
185 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  27.38 
 
 
227 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  26.16 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  27.38 
 
 
199 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  27.38 
 
 
199 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  27.38 
 
 
199 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  26.22 
 
 
199 aa  53.5  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  24 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>