12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0500 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00540555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0488  hypothetical protein  92.91 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1364  hypothetical protein  27.16 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000024275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  27.98 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  27.33 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  28.66 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  28.66 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  28.66 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  27.38 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  27.38 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  27.38 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  26.22 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>