37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1749 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1749  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  323  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000203551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1478  hypothetical protein  88.62 
 
 
167 aa  300  8.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00307315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0260  protein of unknown function DUF988  38.46 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1233  transporter  37.66 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1404  protein of unknown function DUF988  36.2 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940341  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0990  protein of unknown function DUF988  36.84 
 
 
162 aa  90.9  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.242201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1489  protein of unknown function DUF988  35.54 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0096  hypothetical protein  32 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000816189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1765  protein of unknown function DUF988  29.87 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2273  protein of unknown function DUF988  34.01 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3683  hypothetical protein  33.76 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1323  hypothetical protein  33.76 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1767  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1625  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1513  hypothetical protein  31.85 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1716  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1693  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1509  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1481  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1471  hypothetical protein  32.48 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00963664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1662  hypothetical protein  31.85 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1496  hypothetical protein  32.92 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.327831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07380  predicted membrane protein  31.21 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0562759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1440  hypothetical protein  32.47 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1240  hypothetical protein  41.98 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.32555  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0847  hypothetical protein  33.14 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000607562  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1514  hypothetical protein  41.67 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2506  protein of unknown function DUF988  27.92 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1797  transporter  29.09 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1325  protein of unknown function DUF988  33.57 
 
 
208 aa  60.8  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00310144  hitchhiker  0.000548247 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2119  hypothetical protein  27.78 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3047  protein of unknown function DUF988  30.43 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0849  hypothetical protein  36.79 
 
 
169 aa  54.3  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0296  hypothetical protein  26.24 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1481  protein of unknown function DUF988  29.56 
 
 
179 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.674772  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1509  hypothetical protein  35.63 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000920672  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0124  hypothetical protein  32.67 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>