22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1325 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1325  protein of unknown function DUF988  100 
 
 		 208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00310144  hitchhiker  0.000548247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3047  protein of unknown function DUF988  66.85 
 
 		 189 aa  228  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07380  predicted membrane protein  35.39 
 
 		 150 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0562759  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0260  protein of unknown function DUF988  38.3 
 
 		 163 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1481  protein of unknown function DUF988  41.03 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.674772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1489  protein of unknown function DUF988  33.92 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1233  transporter  32.95 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1440  hypothetical protein  34.48 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0746936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1404  protein of unknown function DUF988  32.8 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1749  hypothetical protein  33.52 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000203551  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1496  hypothetical protein  35.77 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.327831  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1478  hypothetical protein  32.22 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00307315  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2273  protein of unknown function DUF988  40.27 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0096  hypothetical protein  31.1 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000816189  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0990  protein of unknown function DUF988  37.89 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.242201  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1514  hypothetical protein  36.67 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0847  hypothetical protein  29.32 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000607562  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1240  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.32555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0849  hypothetical protein  29.67 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0124  hypothetical protein  30.95 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0296  hypothetical protein  31.73 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1513  hypothetical protein  28.22 
 
 		 162 aa  41.6  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>