17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00790 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00790  expressed protein  100 
 
 
846 aa  1765    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00410  expressed protein  46.07 
 
 
748 aa  429  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.202532  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01680  hypothetical protein  34.94 
 
 
900 aa  271  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01040  hypothetical protein  26.19 
 
 
882 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.149993  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01580  expressed protein  28.65 
 
 
910 aa  127  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30826  predicted protein  34.72 
 
 
687 aa  50.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303206  normal  0.679576 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05700  hypothetical protein  58.06 
 
 
897 aa  49.3  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03650  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25.12 
 
 
815 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653785 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10128  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.31 
 
 
1065 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0112163  normal  0.804526 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10606  conserved hypothetical protein  66.67 
 
 
725 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0858938  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10912  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.06 
 
 
448 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.671703  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06322  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  62.07 
 
 
523 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00850  expressed protein  50 
 
 
640 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11185  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  42.62 
 
 
779 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.298239 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58009  Fungal transcriptional regulatory protein  24.12 
 
 
1047 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.513512  normal  0.0535661 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05390  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.63 
 
 
706 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00098  Nitrogen assimilation transcription factor nirA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P28348]  37.78 
 
 
892 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>