23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01580 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01580  expressed protein  100 
 
 
910 aa  1896    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01680  hypothetical protein  28.35 
 
 
900 aa  171  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00410  expressed protein  28.51 
 
 
748 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.202532  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00790  expressed protein  28.65 
 
 
846 aa  127  8.000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01040  hypothetical protein  24.38 
 
 
882 aa  124  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.149993  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05050  hypothetical protein  46.25 
 
 
751 aa  69.3  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10105  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  34.41 
 
 
1119 aa  52.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227022  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05720  hypothetical protein  27.45 
 
 
698 aa  51.2  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0956487  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03650  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.36 
 
 
815 aa  50.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.653785 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00110  conserved hypothetical protein  41.03 
 
 
803 aa  49.3  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.064072  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28979  predicted protein  57.14 
 
 
620 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.174644  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65252  putative transcriptional regulatory protein  54.29 
 
 
674 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.361708 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32517  predicted protein  34.25 
 
 
617 aa  47.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.475893  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05700  hypothetical protein  32.14 
 
 
897 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04560  conserved hypothetical protein  31.33 
 
 
810 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07896  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  22.26 
 
 
584 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.565271 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05274  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  25.44 
 
 
636 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80414  MADS box transcription factor  25.86 
 
 
783 aa  45.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.854363 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03050  Putative Zn(II)2Cys6 transcription facto (Eurofung)  44.44 
 
 
804 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.328433 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00110  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
728 aa  45.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.441864  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02410  hypothetical protein  31.76 
 
 
581 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06396  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  55.17 
 
 
772 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00359431  normal  0.0434138 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06218  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  64 
 
 
562 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.992518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>