13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01810 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF01810  5'-3' exoribonuclease, putative  100 
 
 
1127 aa  2315    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420898  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00707  5'-3' exoribonuclease 2 (EC 3.1.13.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFH3]  52.83 
 
 
1032 aa  582  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_526  predicted protein  51.87 
 
 
802 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.306945  normal  0.90792 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03620  Exonuclease II, putative  39.83 
 
 
1457 aa  314  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11052  exonuclease II (Eurofung)  37.65 
 
 
1398 aa  308  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0617559  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41082  predicted protein  43.7 
 
 
509 aa  297  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523535  normal  0.0326326 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5588  predicted protein  46.99 
 
 
156 aa  161  6e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0161736  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15233  predicted protein  40.67 
 
 
151 aa  105  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0435  hypothetical protein  40.66 
 
 
323 aa  55.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18607  predicted protein  21.07 
 
 
780 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1469  hypothetical protein  33.6 
 
 
240 aa  53.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000606848  normal  0.0260491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0701  RDD domain containing protein  37.41 
 
 
373 aa  49.7  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45854  predicted protein  35.71 
 
 
1689 aa  49.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0900508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>