18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03810 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03810  transcription factor binding protein, putative  100 
 
 		 1067 aa  2184    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01777  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09000)  43.42 
 
 		 889 aa  77.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0528439 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76943  hypothetical protein  36.49 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.100507  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04694  transcriptional regulator (Cti6), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08840)  45.31 
 
 		 606 aa  74.7  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04280  histone deacetylation-related protein, putative  43.4 
 
 		 1615 aa  67.4  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80251  predicted protein  34.31 
 
 		 1030 aa  62.4  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28834  predicted protein  42 
 
 		 374 aa  53.9  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03668  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12400)  34.29 
 
 		 827 aa  52.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0219111  normal  0.0876759 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47023  predicted protein  51.43 
 
 		 581 aa  52.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07455  JmjC domain-containing histone demethylation protein 1 (EC 1.14.11.27)([Histone-H3]-lysine-36 demethylase 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW75]  27.18 
 
 		 1407 aa  51.6  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.196095 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24586  predicted protein  34.62 
 
 		 795 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.578233  normal  0.245403 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00986  PHD finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16745)  38.3 
 
 		 748 aa  48.5  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114897  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50138  predicted protein  39.58 
 
 		 1699 aa  48.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05891  PHD finger and SET domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11210)  37.29 
 
 		 903 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01770  transcriptional activator, putative  31.82 
 
 		 587 aa  45.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01620  transcriptional activator, putative  38.3 
 
 		 1242 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722836  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  33.33 
 
 		 1717 aa  44.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33654  predicted protein  25.88 
 
 		 479 aa  44.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>