17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF04280 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF04280  histone deacetylation-related protein, putative  100 
 
 		 1615 aa  3234    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05891  PHD finger and SET domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11210)  24.7 
 
 		 903 aa  82.4  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80251  predicted protein  34.43 
 
 		 1030 aa  76.3  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03810  transcription factor binding protein, putative  43.4 
 
 		 1067 aa  67  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28834  predicted protein  45.45 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76943  hypothetical protein  51.28 
 
 		 397 aa  60.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.100507  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01777  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09000)  30.38 
 
 		 889 aa  58.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0528439 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00900  hypothetical protein  28.05 
 
 		 746 aa  57.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24586  predicted protein  38.6 
 
 		 795 aa  54.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.578233  normal  0.245403 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47023  predicted protein  37.93 
 
 		 581 aa  53.9  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04694  transcriptional regulator (Cti6), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08840)  50 
 
 		 606 aa  52.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31672  predicted protein  25.35 
 
 		 732 aa  51.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.418717 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03810  histone-lysine N-methyltransferase, putative  25.17 
 
 		 834 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00986  PHD finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G16745)  36.84 
 
 		 748 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114897  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08825  Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 specific (EC 2.1.1.43)(SET domain-containing protein 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ASA5]  21.83 
 
 		 980 aa  50.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01770  transcriptional activator, putative  30.88 
 
 		 587 aa  49.3  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08211  PHD transcription factor (Rum1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03430)  41.18 
 
 		 1717 aa  46.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>