12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01590 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01590  Rab escort protein, putative  100 
 
 		 500 aa  1026    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85246  predicted protein  30.86 
 
 		 632 aa  179  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90444  Secretory pathway GDP dissociation inhibitor  29.68 
 
 		 454 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.120093 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00140  RAB GDP-dissociation inhibitor, putative  31 
 
 		 551 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05895  secretory pathway gdp dissociation inhibitor (AFU_orthologue; AFUA_2G11150)  25.79 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.438112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_17984  predicted protein  24.74 
 
 		 552 aa  108  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.247444  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14827  predicted protein  25.56 
 
 		 446 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293303  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42040  predicted protein  28.62 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43871  predicted protein  28.14 
 
 		 673 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  64.1 
 
 		 522 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  48.89 
 
 		 245 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  53.85 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>