13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00640 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA00640  integral to plasma membrane protein, putative  100 
 
 
551 aa  1115    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10377  DUF580 domain protein Pns1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12970)  36.14 
 
 
533 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.173426  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34117  predicted protein  38.89 
 
 
516 aa  326  7e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00012281  normal  0.103056 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46998  predicted protein  27.42 
 
 
480 aa  163  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291299  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13553  predicted protein  32 
 
 
250 aa  113  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0118726  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_5491  predicted protein  30.37 
 
 
210 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.223661  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32929  predicted protein  25.14 
 
 
794 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36842  predicted protein  22.06 
 
 
762 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27894  predicted protein  29.2 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.404888  normal  0.456946 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00800  expressed protein  24.18 
 
 
699 aa  57.4  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36848  predicted protein  21.08 
 
 
424 aa  53.9  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33567  predicted protein  27.73 
 
 
396 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416798  normal  0.0211717 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  30.77 
 
 
311 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>