16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0199 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0199  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0843  hypothetical protein  33.61 
 
 
245 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1881  hypothetical protein  26.75 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2451  Protein of unknown function DUF2490  27.16 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0238448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3713  hypothetical protein  28.87 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0036  hypothetical protein  30.29 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0467  Protein of unknown function DUF2490  26.6 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0035  hypothetical protein  29.33 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09111  hypothetical protein  25.1 
 
 
233 aa  58.9  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0798  hypothetical protein  27 
 
 
225 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0407  hypothetical protein  25.35 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.858732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1902  hypothetical protein  22.81 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.758588  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3816  hypothetical protein  25.6 
 
 
337 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0949  hypothetical protein  27.83 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0985207  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1093  hypothetical protein  27.83 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.437433  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04575  hypothetical protein  29.13 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>