18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0035 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0035  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0036  hypothetical protein  94.58 
 
 
240 aa  472  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1902  hypothetical protein  32.86 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.758588  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0798  hypothetical protein  32.81 
 
 
225 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0291  hypothetical protein  31.75 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0335  hypothetical protein  30.56 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.813435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0949  hypothetical protein  31.86 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0985207  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1093  hypothetical protein  31.86 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.437433  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0367  hypothetical protein  30.69 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0945  hypothetical protein  31.11 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.747023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2510  putative lipoprotein  26.86 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0843  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3713  hypothetical protein  29.55 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1625  putative lipoprotein  27.66 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0467  Protein of unknown function DUF2490  31.43 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0199  hypothetical protein  29.33 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1881  hypothetical protein  30.52 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2451  Protein of unknown function DUF2490  30 
 
 
257 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0238448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>