20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0843 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0843  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0199  hypothetical protein  33.61 
 
 
253 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3713  hypothetical protein  31.74 
 
 
233 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2451  Protein of unknown function DUF2490  27.12 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0238448  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1881  hypothetical protein  26.97 
 
 
245 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0036  hypothetical protein  28.38 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0467  Protein of unknown function DUF2490  28.11 
 
 
261 aa  72  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0798  hypothetical protein  28.57 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0035  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09111  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1902  hypothetical protein  25.85 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.758588  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0291  hypothetical protein  29.88 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.346529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0335  hypothetical protein  24.77 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.813435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1093  hypothetical protein  27.56 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.437433  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0367  hypothetical protein  28.66 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0949  hypothetical protein  27.56 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0985207  normal  0.861586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0407  hypothetical protein  27.37 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.858732  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2510  putative lipoprotein  24.36 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.417254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0945  hypothetical protein  24.86 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.747023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1625  putative lipoprotein  27.61 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>