More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1218 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1218  electron transfer flavoprotein beta-subunit  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0473626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1263  electron transfer flavoprotein, beta subunit  99.2 
 
 
250 aa  494  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2131  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.65 
 
 
249 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1223  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  318  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181506  normal  0.15593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1608  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.48 
 
 
249 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3143  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3012  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  316  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2299  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  316  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3731  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2810  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  316  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.194225  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0178  electron transfer flavoprotein beta-subunit  62.14 
 
 
249 aa  314  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0148  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.84 
 
 
249 aa  314  8e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1211  electron transfer flavoprotein subunit beta  60.64 
 
 
249 aa  313  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2639  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1402  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.881408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2168  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.84 
 
 
249 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0160278  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2390  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  311  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.424195  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1701  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  62.25 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1296  putative electron transfer flavoprotein (beta-subunit)  61.45 
 
 
249 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1989  Sigma 54 interacting domain protein  59.44 
 
 
251 aa  311  7.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1957  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.41834  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4166  electron transfer flavoprotein beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4307  electron transfer flavoprotein beta-subunit  60.24 
 
 
249 aa  310  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4188  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000750076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3196  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  62.55 
 
 
249 aa  309  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.410827  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3077  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.84 
 
 
249 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2960  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  63.37 
 
 
249 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1822  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1542  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.85 
 
 
249 aa  308  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24214  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2985  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.04 
 
 
249 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26291  hitchhiker  0.000621115 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0857  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  61.45 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0762  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.64 
 
 
249 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3781  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.04 
 
 
249 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2268  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.84 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.074688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2730  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.63 
 
 
249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2007  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.64 
 
 
249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760163  normal  0.289135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0923  electron transfer flavoprotein subunit beta  60.64 
 
 
249 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421451  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0421  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  305  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7298  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.84 
 
 
249 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207608  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2209  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.43 
 
 
249 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2093  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  304  9.000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0864  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.84 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0174422  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25860  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.064795  normal  0.177804 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2540  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0011084 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0411  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3374  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.84 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2977  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2867  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.101956  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1653  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2928  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0218  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0931  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0942  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  60.24 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.85841  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2555  electron transfer flavoprotein, beta subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0938  electron transfer flavoprotein beta-subunit  60.24 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2707  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.43 
 
 
249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462646  normal  0.372016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1194  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3526  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4117  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.83 
 
 
249 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.838389  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0512  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  301  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0998  electron transfer flavoprotein subunit beta  60.64 
 
 
249 aa  301  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740496  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3598  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.04 
 
 
249 aa  301  9e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4829  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.63 
 
 
249 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2174  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.83 
 
 
249 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.892923  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4175  electron transfer flavoprotein subunit beta  59.84 
 
 
249 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00698848  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1021  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2242  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438561  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1062  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1971  electron transfer flavoprotein, beta subunit  58.44 
 
 
248 aa  299  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1896  electron transfer flavoprotein, beta subunit  58.44 
 
 
248 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2133  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  55.82 
 
 
249 aa  298  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1995  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.43 
 
 
249 aa  298  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184939  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0793  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.335872  normal  0.477243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1140  electron transfer flavoprotein subunit beta  58.63 
 
 
249 aa  298  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2185  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.43 
 
 
249 aa  297  8e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4202  electron transfer flavoprotein, beta subunit  57.03 
 
 
249 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1651  electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit-like protein  57.03 
 
 
249 aa  297  9e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3774  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2159  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  59.44 
 
 
249 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.205102  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15180  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.43 
 
 
249 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1011  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.61 
 
 
248 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14280  Electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.03 
 
 
256 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577888  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1471  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  295  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00534232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0546  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.5 
 
 
253 aa  295  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0583  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.04 
 
 
249 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2363  electron transfer flavoprotein beta-subunit  58.23 
 
 
249 aa  295  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0460  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.63 
 
 
249 aa  294  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7939  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  58.63 
 
 
249 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1613  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.2 
 
 
250 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0737  electron transfer flavoprotein beta-subunit  57.03 
 
 
267 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0122378  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0217  electron transfer flavoprotein beta subunit  57.54 
 
 
252 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2550  electron transfer flavoprotein subunit beta  57.43 
 
 
249 aa  292  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4010  electron transfer flavoprotein beta subunit  61.45 
 
 
249 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0930  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.63 
 
 
249 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0819  electron transfer flavoprotein subunit beta  55.82 
 
 
249 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5232  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  57.03 
 
 
249 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0937638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4880  electron transfer flavoprotein beta-subunit  56.22 
 
 
249 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3033  electron transfer flavoprotein beta-subunit  59.04 
 
 
249 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3271  electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  56.38 
 
 
249 aa  290  1e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3481  electron transfer flavoprotein beta-subunit  55.42 
 
 
249 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>