16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1261 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1261  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7637  LrgA  79.55 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  79.55 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  77.27 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  74.47 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  77.27 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  77.27 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6616  LrgA family protein  77.27 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.112454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  80.43 
 
 
123 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  44.44 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  44.44 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  38.24 
 
 
128 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  42.86 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  46.51 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  42.22 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>