26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4466 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4466  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7107  hypothetical protein  78.57 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3210  hypothetical protein  62.34 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0026  hypothetical protein  65.33 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0044  hypothetical protein  88.89 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0967  hypothetical protein  66.07 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.997665  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7941  hypothetical protein  49.12 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3774  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0291  hypothetical protein  48.61 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1778  hypothetical protein  56.36 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.307471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0307  hypothetical protein  52.46 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2676  hypothetical protein  59.18 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0025  hypothetical protein  62.5 
 
 		 50 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0273  hypothetical protein  45.59 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0384  hypothetical protein  54.05 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.953728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3617  hypothetical protein  59.57 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3908  hypothetical protein  56 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5375  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00434628  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2684  hypothetical protein  54.72 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0308  hypothetical protein  57.89 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3760  hypothetical protein  45.07 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4295  hypothetical protein  54.9 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5487  hypothetical protein  51.61 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0352  hypothetical protein  68.42 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.506567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0217  hypothetical protein  47.92 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.357696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4454  hypothetical protein  56 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>