25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3908 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3908  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  178  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3617  hypothetical protein  98.92 
 
 		 93 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0307  hypothetical protein  74.74 
 
 		 95 aa  133  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0291  hypothetical protein  69.15 
 
 		 94 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7941  hypothetical protein  65.59 
 
 		 93 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4295  hypothetical protein  87.1 
 
 		 93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3774  hypothetical protein  72.6 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5375  hypothetical protein  69.23 
 
 		 87 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00434628  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0273  hypothetical protein  67.06 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7107  hypothetical protein  54.84 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0967  hypothetical protein  68.18 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.997665  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4466  hypothetical protein  55.36 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3210  hypothetical protein  46.97 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3760  hypothetical protein  45.95 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1778  hypothetical protein  54 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.307471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0384  hypothetical protein  53.97 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.953728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0308  hypothetical protein  64.44 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0044  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0026  hypothetical protein  46.94 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2676  hypothetical protein  51.92 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5487  hypothetical protein  46.77 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0217  hypothetical protein  52.83 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.357696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0352  hypothetical protein  70.27 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.506567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5197  hypothetical protein  65.22 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2684  hypothetical protein  48.21 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>