28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5487 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5487  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0384  hypothetical protein  61.29 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.953728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3760  hypothetical protein  64.52 
 
 
73 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0308  hypothetical protein  66.13 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342813 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0217  hypothetical protein  67.39 
 
 
93 aa  61.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.357696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0352  hypothetical protein  81.58 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.506567  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0967  hypothetical protein  56.92 
 
 
73 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.997665  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1778  hypothetical protein  55.36 
 
 
73 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.307471  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2676  hypothetical protein  67.5 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15023  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0307  hypothetical protein  49.12 
 
 
95 aa  52  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0291  hypothetical protein  46.55 
 
 
94 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3210  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2684  hypothetical protein  63.27 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0026  hypothetical protein  62.22 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0273  hypothetical protein  46.03 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7107  hypothetical protein  53.33 
 
 
79 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5375  hypothetical protein  53.85 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00434628  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3774  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281679  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0858  hypothetical protein  82.35 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.922145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2029  hypothetical protein  46.77 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.479458  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7941  hypothetical protein  53.33 
 
 
93 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0044  hypothetical protein  65.85 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.862683  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4466  hypothetical protein  55.36 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0922  hypothetical protein  82.61 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.02589  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0883  hypothetical protein  82.61 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.755971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3617  hypothetical protein  53.06 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380904  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4295  hypothetical protein  60 
 
 
93 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779161  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3908  hypothetical protein  65.62 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>