26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1778 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1778  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.307471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2676  hypothetical protein  68.63 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0967  hypothetical protein  70.59 
 
 		 73 aa  73.6  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.997665  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0291  hypothetical protein  54.1 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7107  hypothetical protein  54.24 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0307  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0384  hypothetical protein  56.45 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.953728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4466  hypothetical protein  55.36 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0308  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.342813 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7941  hypothetical protein  57.41 
 
 		 93 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3774  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3210  hypothetical protein  47.54 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3760  hypothetical protein  56.25 
 
 		 73 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0273  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5487  hypothetical protein  53.33 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0026  hypothetical protein  51.92 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5375  hypothetical protein  59.57 
 
 		 87 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00434628  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0044  hypothetical protein  60.47 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.862683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3617  hypothetical protein  55.32 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4295  hypothetical protein  61.36 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0217  hypothetical protein  55.77 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.357696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2684  hypothetical protein  55.77 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3908  hypothetical protein  53.19 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0352  hypothetical protein  71.79 
 
 		 56 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.506567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4454  hypothetical protein  65.96 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5197  hypothetical protein  65.38 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>