28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0044 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0044  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.862683  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3210  hypothetical protein  86.9 
 
 
84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0026  hypothetical protein  75 
 
 
84 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7107  hypothetical protein  75.71 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.75876  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4466  hypothetical protein  79.63 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0045  hypothetical protein  75.41 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.684692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0025  hypothetical protein  75.41 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0967  hypothetical protein  53.23 
 
 
73 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.997665  normal  0.635417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3774  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281679  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0291  hypothetical protein  42.03 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7941  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0025  hypothetical protein  72.09 
 
 
50 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246457  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0307  hypothetical protein  43.94 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3760  hypothetical protein  49.25 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0432605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1778  hypothetical protein  54.55 
 
 
73 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.307471  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0273  hypothetical protein  47.46 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2676  hypothetical protein  54 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15023  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0384  hypothetical protein  52.38 
 
 
75 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.953728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5375  hypothetical protein  47.37 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00434628  normal  0.527064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5487  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3617  hypothetical protein  53.06 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380904  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0308  hypothetical protein  56.86 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.342813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4295  hypothetical protein  52 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779161  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3908  hypothetical protein  53.06 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2684  hypothetical protein  73.53 
 
 
73 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0217  hypothetical protein  41.38 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.357696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0352  hypothetical protein  63.16 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.506567  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2029  hypothetical protein  43.1 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.479458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>