61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1844 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1844  ribosomal protein L29  100 
 
 
68 aa  134  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.39739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0497  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  36.07 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  40.74 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  38.18 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  45.83 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  45.83 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  45.83 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  45.83 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  38.89 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  45.83 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  45.83 
 
 
63 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  38.89 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  38.89 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  32.2 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  32.2 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0775  50S ribosomal protein L29  38.1 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  42.31 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  32.2 
 
 
69 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  34.55 
 
 
64 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  33.87 
 
 
66 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  33.9 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  33.87 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  33.87 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  33.87 
 
 
71 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  44.44 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1130  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
66 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00158557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  34.62 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  37.74 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0402  50S ribosomal protein L29  37.74 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  48 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  37.74 
 
 
66 aa  40  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  40.74 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
63 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
63 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>